MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187082	G	7	7	16	22	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187082	GC	3	6	63	68	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NT_187082	C	6	6	123	128	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NT_187082	A	8	8	148	155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187082	G	7	7	198	204	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187082	AC	3	6	232	237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NT_187082	TGC	2	6	286	291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187082	G	6	6	302	307	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187082	CTA	2	6	318	323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187082	TCAT	2	8	3011	3018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NT_187082	A	6	6	3034	3039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187082	GCC	2	6	3066	3071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NT_187082	GAG	2	6	3083	3088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187082	CTT	2	6	3365	3370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187082	AC	3	6	3433	3438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NT_187082	CGC	2	6	3444	3449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NT_187082	TAC	2	6	3470	3475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187082	GCA	2	6	3581	3586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187082	A	6	6	3603	3608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187082	AAT	2	6	4363	4368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187082	CAGG	2	8	7892	7899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NT_187082	ACG	2	6	7911	7916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187082	T	6	6	7944	7949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187082	GTT	2	6	8955	8960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187082	A	7	7	9000	9006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187082	ATC	2	6	9075	9080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187082	TTAA	2	8	9088	9095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187082	CT	3	6	9137	9142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NT_187082	TGT	2	6	9158	9163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187082	CTG	2	6	9196	9201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187082	GAA	2	6	9221	9226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187082	A	7	7	9225	9231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187082	TATG	2	8	9238	9245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187082	TGC	2	6	9246	9251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187082	CATG	2	8	9257	9264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NT_187082	TCT	2	6	9353	9358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_187082	GC	3	6	9377	9382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NT_187082	CAGG	2	8	9450	9457	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NT_187082	AG	3	6	9474	9479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187082	GCA	2	6	11799	11804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187082	GCCT	2	8	11822	11829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NT_187082	CGG	2	6	11843	11848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187082	CGC	2	6	11851	11856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NT_187082	CCGAC	2	10	11916	11925	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NT_187082	AGA	2	6	11972	11977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187082	GC	3	6	12016	12021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NT_187082	GAA	2	6	12033	12038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187082	ATGCA	2	10	12043	12052	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NT_187082	GCA	3	9	12086	12094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187082	AGA	2	6	12134	12139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187082	CAG	2	6	12192	12197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187082	GC	3	6	12223	12228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NT_187082	TGA	2	6	12278	12283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187082	CAG	2	6	12375	12380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.